Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP20-1Q3LI63 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms