Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL38Q2WGJ6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL38Q2WGJ6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms