Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LETM2Q2VYF4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LETM2Q2VYF4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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