Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSR1Q2NL82 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSR1Q2NL82 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms