Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISXQ2M1V0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms