Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK3Q16288 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NTRK3Q16288 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NTRK3Q16288 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
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