Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK4Q16099 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK4Q16099 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIK4Q16099 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK4Q16099 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK4Q16099 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK4Q16099 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK4Q16099 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK4Q16099 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK4Q16099 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK4Q16099 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK4Q16099 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK4Q16099 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK4Q16099 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK4Q16099 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK4Q16099 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK4Q16099 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms