Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
VPS72Q15906 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VPS72Q15906 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
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