Protein–RNA interactions for Protein: Q15782

CHI3L2, Chitinase-3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L2Q15782 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHI3L2Q15782 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHI3L2Q15782 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms