Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CUL1Q13616 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CUL1Q13616 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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