Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKP2Q13309 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKP2Q13309 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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