Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC16Q13042 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC16Q13042 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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