Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPN13Q12923 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPN13Q12923 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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