Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB40BQ12829 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB40BQ12829 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB40BQ12829 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB40BQ12829 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB40BQ12829 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB40BQ12829 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB40BQ12829 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB40BQ12829 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB40BQ12829 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB40BQ12829 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB40BQ12829 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB40BQ12829 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB40BQ12829 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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RAB40BQ12829 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB40BQ12829 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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RAB40BQ12829 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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RAB40BQ12829 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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RAB40BQ12829 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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RAB40BQ12829 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB40BQ12829 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB40BQ12829 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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RAB40BQ12829 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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RAB40BQ12829 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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RAB40BQ12829 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB40BQ12829 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
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RAB40BQ12829 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB40BQ12829 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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