Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 VPS73YGL104C 1461 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 HGH1YGR187C 1185 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 UBX5YDR330W 1503 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 APE1YKL103C 1545 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 TDA7YNL176C 1911 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 PHO86YJL117W 936 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 CDC8YJR057W 651 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 PFA4YOL003C 1137 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 CWC27YPL064C 906 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 TRM1YDR120C 1713 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 IML2YJL082W 2196 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 UPS3YDR185C 540 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 RIM9YMR063W 720 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 ATG8YBL078C 354 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 VMS1YDR049W 1899 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 MSR1YHR091C 1932 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 YDR444WYDR444W 2064 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 APC9YLR102C 798 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 DER1YBR201W 636 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 IRS4YKR019C 1848 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 PRP19YLL036C 1512 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1B-GR3Q12316 COX23YHR116W 456 nt5.34□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 MRH1YDR033W 963 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 BMH1YER177W 804 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 ZRC1YMR243C 1329 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 XKS1YGR194C 1803 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 NPY1YGL067W 1155 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 VTA1YLR181C 993 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 APE2YKL157W 2859 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 HOM3YER052C 1584 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 CPR6YLR216C 1116 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 COA4YLR218C 453 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 PAM1YDR251W 2493 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 SRB6YBR253W 366 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 OMS1YDR316W 1416 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 PAN1YIR006C 4443 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 YGR051CYGR051C 324 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 MDY2YOL111C 639 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 BOI2YER114C 3123 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 YDR306CYDR306C 1437 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 BNA5YLR231C 1362 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 PEX7YDR142C 1128 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 IRC9YJL142C 393 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 YJR128WYJR128W 360 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 RIM11YMR139W 1113 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 THI7YLR237W 1797 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 SEG2YKL105C 3399 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1B-GR3Q12316 SUE1YPR151C 621 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 NOP7YGR103W 1818 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 NGL2YMR285C 1548 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 COS8YHL048W 1146 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 YBL059WYBL059W 582 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 YOR387CYOR387C 621 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 YPL114WYPL114W 420 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 YML020WYML020W 1995 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 MNN11YJL183W 1269 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 YAR061WYAR061W 204 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 SHE1YBL031W 1017 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 MRPL16YBL038W 699 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 NAT3YPR131C 588 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 YBR137WYBR137W 540 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 MET10YFR030W 3108 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 EXO5YBR163W 1758 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 UTP9YHR196W 1728 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 EXO1YOR033C 2109 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 MCX1YBR227C 1563 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 PRE9YGR135W 777 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 CHD1YER164W 4407 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 YJL175WYJL175W 513 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 MAK16YAL025C 921 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 FSH3YOR280C 801 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 ARG5,6YER069W 2592 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 VBA1YMR088C 1689 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 DRS2YAL026C 4068 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 SPT15YER148W 723 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 YGR053CYGR053C 852 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 TEM1YML064C 738 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 MCK1YNL307C 1128 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 NIP7YPL211W 546 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 AVT1YJR001W 1809 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 YKL050CYKL050C 2769 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 COX14YML129C 213 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 EKI1YDR147W 1605 nt5.21□□□□□ -1.57
TY1B-GR3Q12316 IME4YGL192W 1803 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 APC11YDL008W 498 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 PRE4YFR050C 801 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 RPL8AYHL033C 771 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 RIM15YFL033C 5313 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 AIM17YHL021C 1398 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 HSP82YPL240C 2130 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 YIL054WYIL054W 318 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 YFL052WYFL052W 1398 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 BUB1YGR188C 3066 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 YER034WYER034W 558 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 RAI1YGL246C 1164 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1B-GR3Q12316 TMA10YLR327C 261 nt5.19□□□□□ -1.58
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