Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 CPR8YNR028W 927 nt4.7□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 OSW1YOR255W 837 nt4.7□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 MUM2YBR057C 1101 nt4.7□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 URA3YEL021W 804 nt4.69□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 SPR6YER115C 576 nt4.69□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 SUT1YGL162W 900 nt4.69□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 ERG25YGR060W 930 nt4.69□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YHR054CYHR054C 1065 nt4.69□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YAR023CYAR023C 540 nt4.69□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 POP8YBL018C 402 nt4.69□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 SPS19YNL202W 879 nt4.69□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 TAF3YPL011C 1062 nt4.69□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 TIF5YPR041W 1218 nt4.69□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 DBF2YGR092W 1719 nt4.69□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 SKG3YLR187W 3081 nt4.69□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 CAF4YKR036C 1932 nt4.68□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YER085CYER085C 522 nt4.68□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt4.68□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 POL32YJR043C 1053 nt4.68□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 ORM2YLR350W 651 nt4.68□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 RPS10BYMR230W 318 nt4.68□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YBL094CYBL094C 333 nt4.68□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 CKA2YOR061W 1020 nt4.68□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 TGS1YPL157W 948 nt4.68□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YOR1YGR281W 4434 nt4.68□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 GAS3YMR215W 1575 nt4.68□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt4.68□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt4.68□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 ALG6YOR002W 1635 nt4.68□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 KGD1YIL125W 3045 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 RGP1YDR137W 1992 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 MPH2YDL247W 1830 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 NGL2YMR285C 1548 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 NOP58YOR310C 1536 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 RVB1YDR190C 1392 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 ARN2YHL047C 1863 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 MEC3YLR288C 1425 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YCR100CYCR100C 951 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 HIM1YDR317W 1245 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 TYW3YGL050W 822 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 COX18YGR062C 951 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 PXR1YGR280C 816 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YNL057WYNL057W 333 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 MED7YOL135C 669 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 PRM4YPL156C 855 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 MAK3YPR051W 531 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YPR142CYPR142C 564 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 CSH1YBR161W 1131 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 REI1YBR267W 1182 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YBR292CYBR292C 372 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 UBA2YDR390C 1911 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 FRS1YLR060W 1788 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 KCH1YJR054W 1494 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 SAP4YGL229C 2457 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YTA12YMR089C 2478 nt4.67□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YTA6YPL074W 2265 nt4.66□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 RAD53YPL153C 2466 nt4.66□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 MSS2YDL107W 1056 nt4.66□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 AUA1YFL010W-A 285 nt4.66□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 HOT13YKL084W 351 nt4.66□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 MTD1YKR080W 963 nt4.66□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 UBI4YLL039C 1146 nt4.66□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YLR462WYLR462W 609 nt4.66□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 MDJ2YNL328C 441 nt4.66□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YOL118CYOL118C 309 nt4.66□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 snR17bsnR17b 332 nt4.66□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 CDC28YBR160W 897 nt4.66□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 NOC4YPR144C 1659 nt4.66□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 SYP1YCR030C 2613 nt4.66□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 ADE6YGR061C 4077 nt4.66□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 FBP26YJL155C 1359 nt4.65□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 SSB2YNL209W 1842 nt4.65□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 FPK1YNR047W 2682 nt4.65□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 GGA1YDR358W 1674 nt4.65□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 PCL8YPL219W 1479 nt4.65□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YDL186WYDL186W 834 nt4.65□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 TAF10YDR167W 621 nt4.65□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YFR035CYFR035C 345 nt4.65□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YKL023WYKL023W 834 nt4.65□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YAL066WYAL066W 309 nt4.65□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt4.65□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YBL062WYBL062W 381 nt4.65□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 PNT1YOR266W 1272 nt4.65□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 SET6YPL165C 1122 nt4.65□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 SSH4YKL124W 1740 nt4.65□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 STB3YDR169C 1542 nt4.65□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 MOT2YER068W 1764 nt4.65□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 RTC1YOL138C 4026 nt4.65□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 PBI1YPL272C 1554 nt4.65□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 CEG1YGL130W 1380 nt4.65□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 TYR1YBR166C 1359 nt4.65□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 TDA7YNL176C 1911 nt4.64□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 AXL2YIL140W 2472 nt4.64□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YCR015CYCR015C 954 nt4.64□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 BMH1YER177W 804 nt4.64□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 TPP1YMR156C 717 nt4.64□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt4.64□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 AIM39YOL053W 1188 nt4.64□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 SMA1YPL027W 738 nt4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 295.6 ms