Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY3A-G	Q12173	RAD52	YML032C	1416 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	HSP30	YCR021C	999 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tK(CUU)C	tK(CUU)C	73 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tK(CUU)D1	tK(CUU)D1	73 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tK(CUU)D2	tK(CUU)D2	73 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tK(CUU)E1	tK(CUU)E1	73 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tK(CUU)E2	tK(CUU)E2	73 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tK(CUU)F	tK(CUU)F	73 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tK(CUU)G1	tK(CUU)G1	73 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tK(CUU)G2	tK(CUU)G2	73 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tK(CUU)G3	tK(CUU)G3	73 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tK(CUU)I	tK(CUU)I	73 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tK(CUU)J	tK(CUU)J	73 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tK(CUU)K	tK(CUU)K	73 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tK(CUU)M	tK(CUU)M	73 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tK(CUU)P	tK(CUU)P	73 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tQ(UUG)C	tQ(UUG)C	72 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tQ(UUG)D1	tQ(UUG)D1	72 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tQ(UUG)D2	tQ(UUG)D2	72 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tQ(UUG)D3	tQ(UUG)D3	72 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tQ(UUG)E1	tQ(UUG)E1	72 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tQ(UUG)H	tQ(UUG)H	72 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	tQ(UUG)L	tQ(UUG)L	72 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	RPC19	YNL113W	429 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	SET6	YPL165C	1122 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	SLX1	YBR228W	915 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	CDS1	YBR029C	1374 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	EGT2	YNL327W	3126 nt		4.47	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	VBA2	YBR293W	1425 nt		4.46	□□□□□ -1.69
TY3A-G	Q12173	MNN1	YER001W	2289 nt		4.46	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	GAS5	YOL030W	1455 nt		4.46	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	YDR090C	YDR090C	933 nt		4.46	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	SNM1	YDR478W	597 nt		4.46	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	DCV1	YFR012W	609 nt		4.46	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	RAD27	YKL113C	1149 nt		4.46	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	YDC1	YPL087W	954 nt		4.46	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	YDR261C-D	YDR261C-D	4815 nt		4.46	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	BLM10	YFL007W	6432 nt		4.45	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	YCR006C	YCR006C	474 nt		4.45	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	PER1	YCR044C	1074 nt		4.45	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	KTR2	YKR061W	1278 nt		4.45	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	ARC40	YBR234C	1155 nt		4.45	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	MDL1	YLR188W	2088 nt		4.44	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	YER134C	YER134C	537 nt		4.44	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	YGL214W	YGL214W	486 nt		4.44	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	YLR036C	YLR036C	612 nt		4.44	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	YPR174C	YPR174C	666 nt		4.44	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	OLE1	YGL055W	1533 nt		4.44	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	EAR1	YMR171C	1653 nt		4.44	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	SSA2	YLL024C	1920 nt		4.44	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	CDC15	YAR019C	2925 nt		4.44	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	ISR1	YPR106W	1332 nt		4.44	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	RAD4	YER162C	2265 nt		4.43	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	MAD3	YJL013C	1548 nt		4.43	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	RPL24A	YGL031C	468 nt		4.43	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	SRB5	YGR104C	924 nt		4.43	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	RPS0B	YLR048W	759 nt		4.43	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	ILV5	YLR355C	1188 nt		4.43	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	SAT4	YCR008W	1812 nt		4.43	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	FAR10	YLR238W	1437 nt		4.43	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	SAS10	YDL153C	1833 nt		4.42	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	SSB1	YDL229W	1842 nt		4.42	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	YBR225W	YBR225W	2703 nt		4.42	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	YDL071C	YDL071C	375 nt		4.42	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	FBP1	YLR377C	1047 nt		4.42	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	YML116W-A	YML116W-A	303 nt		4.42	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	YOL035C	YOL035C	303 nt		4.42	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	OM14	YBR230C	405 nt		4.42	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	RPO21	YDL140C	5202 nt		4.42	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	PRD1	YCL057W	2139 nt		4.42	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	VPS30	YPL120W	1674 nt		4.41	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	YPL260W	YPL260W	1656 nt		4.41	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	CDC6	YJL194W	1542 nt		4.41	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	NUP2	YLR335W	2163 nt		4.41	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	AAD3	YCR107W	1092 nt		4.41	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	MHO1	YJR008W	1017 nt		4.41	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	UIP3	YAR027W	708 nt		4.41	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	YMR084W	YMR084W	789 nt		4.41	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	YMR315W	YMR315W	1050 nt		4.41	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	NCE102	YPR149W	522 nt		4.41	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	YBR196C-B	YBR196C-B	105 nt		4.41	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	TAF12	YDR145W	1620 nt		4.4	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	OPT2	YPR194C	2634 nt		4.4	□□□□□ -1.7
TY3A-G	Q12173	LPP1	YDR503C	825 nt		4.4	□□□□□ -1.71
TY3A-G	Q12173	YER085C	YER085C	522 nt		4.4	□□□□□ -1.71
TY3A-G	Q12173	BUD13	YGL174W	801 nt		4.4	□□□□□ -1.71
TY3A-G	Q12173	SDS3	YIL084C	984 nt		4.4	□□□□□ -1.71
TY3A-G	Q12173	YIL163C	YIL163C	354 nt		4.4	□□□□□ -1.71
TY3A-G	Q12173	GTT1	YIR038C	705 nt		4.4	□□□□□ -1.71
TY3A-G	Q12173	TVP38	YKR088C	1014 nt		4.4	□□□□□ -1.71
TY3A-G	Q12173	YBR219C	YBR219C	384 nt		4.4	□□□□□ -1.71
TY3A-G	Q12173	TIF4632	YGL049C	2745 nt		4.4	□□□□□ -1.71
TY3A-G	Q12173	STR2	YJR130C	1920 nt		4.4	□□□□□ -1.71
TY3A-G	Q12173	BRE4	YDL231C	3378 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TY3A-G	Q12173	TRM44	YPL030W	1704 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TY3A-G	Q12173	YIL152W	YIL152W	708 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TY3A-G	Q12173	IMP2	YMR035W	534 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TY3A-G	Q12173	IMP1	YMR150C	573 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TY3A-G	Q12173	POP4	YBR257W	840 nt		4.39	□□□□□ -1.71
TY3A-G	Q12173	IMA3	YIL172C	1770 nt		4.39	□□□□□ -1.71

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