Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC173Q0VFZ6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC173Q0VFZ6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms