Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 APM2YHL019C 1818 nt5.14□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 BUD8YLR353W 1812 nt5.14□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 STB3YDR169C 1542 nt5.14□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 PDE1YGL248W 1110 nt5.14□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 ECT1YGR007W 972 nt5.14□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 GTT1YIR038C 705 nt5.14□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 CDC8YJR057W 651 nt5.14□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 TTI2YJR136C 1266 nt5.14□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 VPS71YML041C 843 nt5.14□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt5.14□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YNG1YOR064C 660 nt5.14□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 DCI1YOR180C 816 nt5.14□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 SRB6YBR253W 366 nt5.14□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 HAP1YLR256W 4509 nt5.13□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 MCH4YOL119C 1506 nt5.13□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 HRP1YOL123W 1605 nt5.13□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 HMRA1YCR097W 381 nt5.13□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YER085CYER085C 522 nt5.13□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.13□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YMR181CYMR181C 465 nt5.13□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YBR013CYBR013C 390 nt5.13□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YPR071WYPR071W 636 nt5.13□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 MRP2YPR166C 348 nt5.13□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt5.13□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 FBP26YJL155C 1359 nt5.13□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 WTM2YOR229W 1404 nt5.13□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 FOL1YNL256W 2475 nt5.13□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 PAL1YDR348C 1500 nt5.13□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YDR444WYDR444W 2064 nt5.12□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YMR1YJR110W 2067 nt5.12□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 SED4YCR067C 3198 nt5.12□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YDR042CYDR042C 603 nt5.12□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 CPR1YDR155C 489 nt5.12□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 PLP1YDR183W 693 nt5.12□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 DCV1YFR012W 609 nt5.12□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt5.12□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 NDL1YLR254C 570 nt5.12□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 GAB1YLR459W 1185 nt5.12□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 TAP42YMR028W 1101 nt5.12□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 SOL1YNR034W 966 nt5.12□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 GPM3YOL056W 912 nt5.12□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt5.12□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 MEK1YOR351C 1494 nt5.12□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 CDC4YFL009W 2340 nt5.12□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 SNT2YGL131C 4212 nt5.12□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt5.11□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 STE2YFL026W 1296 nt5.11□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt5.11□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 IRC25YLR021W 540 nt5.11□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YLR407WYLR407W 687 nt5.11□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.11□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 HLJ1YMR161W 675 nt5.11□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 END3YNL084C 1050 nt5.11□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YNL171CYNL171C 369 nt5.11□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 RPS19BYNL302C 435 nt5.11□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 MAP2YBL091C 1266 nt5.11□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 SPO19YPL130W 672 nt5.11□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 LOA1YPR139C 903 nt5.11□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YMD8YML038C 1329 nt5.11□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 SRO9YCL037C 1305 nt5.11□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 GPM2YDL021W 936 nt5.1□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 RRP8YDR083W 1179 nt5.1□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 TMN2YDR107C 2019 nt5.1□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YDR220CYDR220C 294 nt5.1□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 CEG1YGL130W 1380 nt5.1□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 CAX4YGR036C 720 nt5.1□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 PEF1YGR058W 1008 nt5.1□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 RPC25YKL144C 639 nt5.1□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 MRPL39YML009C 213 nt5.1□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 TGS1YPL157W 948 nt5.1□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 BRF1YGR246C 1791 nt5.09□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 NOC4YPR144C 1659 nt5.09□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 LDB17YDL146W 1476 nt5.09□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 TYR1YBR166C 1359 nt5.09□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.09□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 PEX21YGR239C 867 nt5.09□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YJR071WYJR071W 369 nt5.09□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt5.09□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 MDJ2YNL328C 441 nt5.09□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 IZH4YOL101C 939 nt5.09□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 SET6YPL165C 1122 nt5.09□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 MUM2YBR057C 1101 nt5.09□□□□□ -1.59
SGO1Q08490 PXA1YPL147W 2613 nt5.09□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 HOF1YMR032W 2010 nt5.08□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 YDL027CYDL027C 1263 nt5.08□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 YGR149WYGR149W 1299 nt5.08□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 PER33YLR064W 822 nt5.08□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 YBL096CYBL096C 309 nt5.08□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 YTA6YPL074W 2265 nt5.08□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 TPS3YMR261C 3165 nt5.08□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 STE7YDL159W 1548 nt5.07□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 ATG20YDL113C 1923 nt5.07□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 ARN2YHL047C 1863 nt5.07□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 ADE6YGR061C 4077 nt5.07□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 SCM3YDL139C 672 nt5.07□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 BNA6YFR047C 888 nt5.07□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 AAD10YJR155W 867 nt5.07□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.07□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 AIM39YOL053W 1188 nt5.07□□□□□ -1.6
SGO1Q08490 ATP20YPR020W 348 nt5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.2 ms