Protein–RNA interactions for Protein: Q08236

AVO1, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO1Q08236 YDR203WYDR203W 318 nt5.65□□□□□ -1.5
AVO1Q08236 DON1YDR273W 1098 nt5.65□□□□□ -1.5
AVO1Q08236 YER010CYER010C 705 nt5.65□□□□□ -1.5
AVO1Q08236 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt5.65□□□□□ -1.5
AVO1Q08236 BET4YJL031C 984 nt5.65□□□□□ -1.5
AVO1Q08236 YLR184WYLR184W 348 nt5.65□□□□□ -1.5
AVO1Q08236 RPS3YNL178W 723 nt5.65□□□□□ -1.5
AVO1Q08236 YBR219CYBR219C 384 nt5.65□□□□□ -1.5
AVO1Q08236 MBP1YDL056W 2502 nt5.65□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 SPO1YNL012W 1896 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 SDA1YGR245C 2304 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YDL027CYDL027C 1263 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 VPS61YDR136C 573 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YGL204CYGL204C 306 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 PRS3YHL011C 963 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 LEU5YHR002W 1074 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 DMA1YHR115C 1251 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 DBP8YHR169W 1296 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YJL193WYJL193W 1209 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YKL162CYKL162C 1209 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 PAU17YLL025W 375 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 SAS2YMR127C 1017 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 TRI1YMR233W 681 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 MIC27YNL100W 705 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 ARG1YOL058W 1263 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 ILV1YER086W 1731 nt5.64□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 MID1YNL291C 1647 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 EAR1YMR171C 1653 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 PRT1YOR361C 2292 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 UBX2YML013W 1755 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 COX9YDL067C 180 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 GAL83YER027C 1254 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 ISC10YER180C 804 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YMR295CYMR295C 594 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 MRPL22YNL177C 930 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 RPC34YNR003C 954 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 EXG1YLR300W 1347 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 CLB2YPR119W 1476 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 SUM1YDR310C 3189 nt5.63□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 PGM1YKL127W 1713 nt5.62□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YHR202WYHR202W 1809 nt5.62□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 TMT1YER175C 900 nt5.62□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 RPN11YFR004W 921 nt5.62□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 RPL24AYGL031C 468 nt5.62□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 RLP24YLR009W 600 nt5.62□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YLR462WYLR462W 609 nt5.62□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 ECM13YBL043W 774 nt5.62□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 MAP2YBL091C 1266 nt5.62□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 CIN2YPL241C 807 nt5.62□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YPR202WYPR202W 717 nt5.62□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt5.62□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 IMA3YIL172C 1770 nt5.62□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 IMA4YJL221C 1770 nt5.62□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 FCF1YDR339C 570 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 OST5YGL226C-A 261 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 CAX4YGR036C 720 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 RME1YGR044C 903 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 TDA10YGR205W 873 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YIL028WYIL028W 399 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 MMF1YIL051C 438 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 POR2YIL114C 846 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 NHA1YLR138W 2958 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 TFS1YLR178C 660 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 MAP1YLR244C 1164 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 VPS38YLR360W 1320 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YLR463CYLR463C 552 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 RER2YBR002C 861 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 PRO2YOR323C 1371 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YMC1YPR058W 924 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YPR172WYPR172W 603 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 SHE3YBR130C 1278 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 HPC2YBR215W 1878 nt5.61□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 TIP20YGL145W 2106 nt5.6□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 RPN4YDL020C 1596 nt5.6□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 URK1YNR012W 1506 nt5.6□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 ASA1YPR085C 1332 nt5.6□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 SIT4YDL047W 936 nt5.6□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 PUS6YGR169C 1215 nt5.6□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt5.6□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YLR334CYLR334C 381 nt5.6□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YML018CYML018C 1182 nt5.6□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YMR099CYMR099C 894 nt5.6□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 FDH2YPL275W 711 nt5.6□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 TNA1YGR260W 1605 nt5.59□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 NOP58YOR310C 1536 nt5.59□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 ERG1YGR175C 1491 nt5.59□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 PCL8YPL219W 1479 nt5.59□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.59□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YGR064WYGR064W 369 nt5.59□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 LNP1YHR192W 837 nt5.59□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YIL163CYIL163C 354 nt5.59□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 SRP21YKL122C 504 nt5.59□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 RPL10YLR075W 666 nt5.59□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 SEN15YMR059W 387 nt5.59□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 YOL150CYOL150C 312 nt5.59□□□□□ -1.51
AVO1Q08236 HXT4YHR092C 1731 nt5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.9 ms