Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNDQ07001 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHRNDQ07001 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHRNDQ07001 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms