Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EGR3Q06889 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms