Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNG1Q06432 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG1Q06432 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms