Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CHRNB3Q05901 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms