Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ROM1Q03395 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ROM1Q03395 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms