Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ID3Q02535 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ID3Q02535 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ID3Q02535 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ID3Q02535 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ID3Q02535 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ID3Q02535 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ID3Q02535 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ID3Q02535 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ID3Q02535 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ID3Q02535 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ID3Q02535 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ID3Q02535 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ID3Q02535 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ID3Q02535 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ID3Q02535 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ID3Q02535 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ID3Q02535 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ID3Q02535 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ID3Q02535 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ID3Q02535 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ID3Q02535 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ID3Q02535 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ID3Q02535 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ID3Q02535 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ID3Q02535 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ID3Q02535 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ID3Q02535 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ID3Q02535 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ID3Q02535 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ID3Q02535 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ID3Q02535 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ID3Q02535 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ID3Q02535 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ID3Q02535 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ID3Q02535 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ID3Q02535 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ID3Q02535 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ID3Q02535 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ID3Q02535 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ID3Q02535 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ID3Q02535 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ID3Q02535 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ID3Q02535 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ID3Q02535 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ID3Q02535 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ID3Q02535 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ID3Q02535 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ID3Q02535 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ID3Q02535 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ID3Q02535 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ID3Q02535 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ID3Q02535 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ID3Q02535 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ID3Q02535 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ID3Q02535 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ID3Q02535 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ID3Q02535 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ID3Q02535 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ID3Q02535 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ID3Q02535 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ID3Q02535 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ID3Q02535 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ID3Q02535 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ID3Q02535 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ID3Q02535 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ID3Q02535 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ID3Q02535 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ID3Q02535 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ID3Q02535 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ID3Q02535 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ID3Q02535 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ID3Q02535 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ID3Q02535 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ID3Q02535 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ID3Q02535 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ID3Q02535 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ID3Q02535 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ID3Q02535 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ID3Q02535 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ID3Q02535 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ID3Q02535 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ID3Q02535 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ID3Q02535 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ID3Q02535 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ID3Q02535 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ID3Q02535 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ID3Q02535 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ID3Q02535 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ID3Q02535 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ID3Q02535 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ID3Q02535 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ID3Q02535 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ID3Q02535 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ID3Q02535 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ID3Q02535 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ID3Q02535 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ID3Q02535 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ID3Q02535 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ID3Q02535 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms