Protein–RNA interactions for Protein: Q00889

PSG6, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 6, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG6Q00889 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSG6Q00889 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSG6Q00889 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms