Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PKD1P98161 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKD1P98161 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PKD1P98161 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PKD1P98161 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PKD1P98161 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKD1P98161 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKD1P98161 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKD1P98161 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKD1P98161 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKD1P98161 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKD1P98161 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKD1P98161 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKD1P98161 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKD1P98161 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKD1P98161 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKD1P98161 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKD1P98161 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKD1P98161 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKD1P98161 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKD1P98161 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PKD1P98161 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKD1P98161 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKD1P98161 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKD1P98161 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKD1P98161 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKD1P98161 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKD1P98161 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKD1P98161 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKD1P98161 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKD1P98161 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKD1P98161 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKD1P98161 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKD1P98161 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKD1P98161 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKD1P98161 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKD1P98161 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PKD1P98161 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKD1P98161 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKD1P98161 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKD1P98161 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKD1P98161 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKD1P98161 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKD1P98161 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKD1P98161 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKD1P98161 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKD1P98161 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKD1P98161 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKD1P98161 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKD1P98161 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PKD1P98161 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKD1P98161 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKD1P98161 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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