Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CCNA1P78396 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNA1P78396 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms