Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHBDL3P58872 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHBDL3P58872 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms