Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCBP3P57721 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCBP3P57721 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PCBP3P57721 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCBP3P57721 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PCBP3P57721 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCBP3P57721 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCBP3P57721 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCBP3P57721 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCBP3P57721 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCBP3P57721 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCBP3P57721 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms