Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNB3P54284 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNB3P54284 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms