Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2KP53803 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLR2KP53803 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms