Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EFNA3P52797 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EFNA3P52797 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms