Protein–RNA interactions for Protein: P51793

CLCN4, H(+)/Cl(-) exchange transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN4P51793 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN4P51793 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN4P51793 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms