Protein–RNA interactions for Protein: P51677

CCR3, C-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR3P51677 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR3P51677 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR3P51677 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR3P51677 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR3P51677 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR3P51677 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR3P51677 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR3P51677 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR3P51677 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR3P51677 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR3P51677 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR3P51677 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR3P51677 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR3P51677 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR3P51677 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR3P51677 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR3P51677 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR3P51677 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR3P51677 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR3P51677 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR3P51677 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR3P51677 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR3P51677 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR3P51677 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR3P51677 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR3P51677 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR3P51677 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR3P51677 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR3P51677 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR3P51677 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR3P51677 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR3P51677 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR3P51677 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR3P51677 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR3P51677 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR3P51677 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR3P51677 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR3P51677 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR3P51677 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR3P51677 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR3P51677 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR3P51677 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR3P51677 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR3P51677 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR3P51677 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR3P51677 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR3P51677 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR3P51677 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR3P51677 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR3P51677 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR3P51677 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR3P51677 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR3P51677 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR3P51677 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR3P51677 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR3P51677 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR3P51677 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR3P51677 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR3P51677 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR3P51677 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR3P51677 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR3P51677 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR3P51677 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR3P51677 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR3P51677 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR3P51677 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR3P51677 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR3P51677 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR3P51677 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR3P51677 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR3P51677 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR3P51677 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR3P51677 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR3P51677 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR3P51677 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR3P51677 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR3P51677 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR3P51677 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR3P51677 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR3P51677 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR3P51677 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR3P51677 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR3P51677 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR3P51677 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR3P51677 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR3P51677 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR3P51677 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR3P51677 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR3P51677 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR3P51677 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR3P51677 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR3P51677 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR3P51677 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR3P51677 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR3P51677 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR3P51677 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR3P51677 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR3P51677 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR3P51677 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR3P51677 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms