Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms