Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GATMP50440 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATMP50440 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATMP50440 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATMP50440 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATMP50440 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATMP50440 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATMP50440 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATMP50440 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GATMP50440 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATMP50440 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GATMP50440 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATMP50440 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GATMP50440 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATMP50440 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATMP50440 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATMP50440 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GATMP50440 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATMP50440 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATMP50440 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATMP50440 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATMP50440 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATMP50440 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATMP50440 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATMP50440 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GATMP50440 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATMP50440 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATMP50440 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATMP50440 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATMP50440 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATMP50440 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATMP50440 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATMP50440 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATMP50440 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATMP50440 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GATMP50440 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATMP50440 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATMP50440 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATMP50440 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATMP50440 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATMP50440 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATMP50440 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATMP50440 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATMP50440 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATMP50440 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GATMP50440 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATMP50440 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATMP50440 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATMP50440 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATMP50440 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATMP50440 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATMP50440 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATMP50440 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATMP50440 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATMP50440 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATMP50440 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATMP50440 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATMP50440 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATMP50440 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GATMP50440 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATMP50440 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATMP50440 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATMP50440 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATMP50440 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATMP50440 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATMP50440 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATMP50440 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATMP50440 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATMP50440 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATMP50440 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATMP50440 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATMP50440 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATMP50440 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATMP50440 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATMP50440 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GATMP50440 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATMP50440 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GATMP50440 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATMP50440 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATMP50440 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATMP50440 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GATMP50440 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GATMP50440 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GATMP50440 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GATMP50440 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GATMP50440 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GATMP50440 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GATMP50440 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GATMP50440 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GATMP50440 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GATMP50440 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GATMP50440 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GATMP50440 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GATMP50440 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATMP50440 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATMP50440 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATMP50440 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATMP50440 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATMP50440 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATMP50440 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms