Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms