Protein–RNA interactions for Protein: P49589

CARS, Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARSP49589 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARSP49589 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARSP49589 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARSP49589 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARSP49589 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARSP49589 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARSP49589 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARSP49589 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARSP49589 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CARSP49589 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARSP49589 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARSP49589 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARSP49589 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARSP49589 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARSP49589 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARSP49589 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARSP49589 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARSP49589 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARSP49589 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARSP49589 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARSP49589 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CARSP49589 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARSP49589 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARSP49589 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARSP49589 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARSP49589 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARSP49589 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARSP49589 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARSP49589 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CARSP49589 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARSP49589 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CARSP49589 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARSP49589 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARSP49589 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARSP49589 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARSP49589 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARSP49589 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CARSP49589 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARSP49589 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARSP49589 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARSP49589 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CARSP49589 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARSP49589 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARSP49589 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARSP49589 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARSP49589 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARSP49589 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARSP49589 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARSP49589 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARSP49589 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CARSP49589 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARSP49589 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARSP49589 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARSP49589 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARSP49589 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARSP49589 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARSP49589 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARSP49589 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARSP49589 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARSP49589 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARSP49589 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARSP49589 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARSP49589 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARSP49589 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARSP49589 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARSP49589 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARSP49589 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARSP49589 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CARSP49589 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARSP49589 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARSP49589 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARSP49589 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARSP49589 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARSP49589 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARSP49589 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARSP49589 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARSP49589 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARSP49589 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARSP49589 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARSP49589 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARSP49589 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARSP49589 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARSP49589 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARSP49589 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARSP49589 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARSP49589 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARSP49589 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARSP49589 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARSP49589 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARSP49589 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARSP49589 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARSP49589 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARSP49589 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CARSP49589 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARSP49589 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARSP49589 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARSP49589 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARSP49589 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARSP49589 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARSP49589 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms