Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALDH9A1P49189 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALDH9A1P49189 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms