Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC6A11P48066 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms