Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPR4P46093 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPR4P46093 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GPR4P46093 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR4P46093 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR4P46093 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR4P46093 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR4P46093 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR4P46093 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR4P46093 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR4P46093 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR4P46093 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR4P46093 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR4P46093 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR4P46093 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR4P46093 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR4P46093 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR4P46093 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR4P46093 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GPR4P46093 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR4P46093 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR4P46093 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR4P46093 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR4P46093 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR4P46093 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR4P46093 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR4P46093 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR4P46093 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR4P46093 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR4P46093 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR4P46093 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR4P46093 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR4P46093 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR4P46093 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR4P46093 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR4P46093 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPR4P46093 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR4P46093 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR4P46093 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR4P46093 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR4P46093 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR4P46093 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR4P46093 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR4P46093 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR4P46093 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR4P46093 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR4P46093 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPR4P46093 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR4P46093 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR4P46093 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR4P46093 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR4P46093 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR4P46093 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR4P46093 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR4P46093 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR4P46093 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR4P46093 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR4P46093 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR4P46093 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR4P46093 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR4P46093 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR4P46093 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR4P46093 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR4P46093 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPR4P46093 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR4P46093 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR4P46093 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR4P46093 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR4P46093 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR4P46093 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR4P46093 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR4P46093 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR4P46093 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR4P46093 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR4P46093 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR4P46093 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR4P46093 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR4P46093 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR4P46093 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR4P46093 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR4P46093 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR4P46093 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR4P46093 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR4P46093 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR4P46093 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR4P46093 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR4P46093 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR4P46093 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR4P46093 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR4P46093 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR4P46093 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR4P46093 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR4P46093 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR4P46093 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR4P46093 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR4P46093 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR4P46093 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR4P46093 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR4P46093 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR4P46093 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms