Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTGER2P43116 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms