Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PIK3CBP42338 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3CBP42338 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3CBP42338 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3CBP42338 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3CBP42338 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3CBP42338 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PIK3CBP42338 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CBP42338 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CBP42338 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CBP42338 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CBP42338 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CBP42338 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CBP42338 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CBP42338 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CBP42338 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PIK3CBP42338 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CBP42338 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CBP42338 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CBP42338 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CBP42338 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CBP42338 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CBP42338 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PIK3CBP42338 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CBP42338 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CBP42338 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CBP42338 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CBP42338 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CBP42338 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CBP42338 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PIK3CBP42338 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIK3CBP42338 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CBP42338 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CBP42338 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CBP42338 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CBP42338 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CBP42338 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CBP42338 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CBP42338 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CBP42338 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIK3CBP42338 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CBP42338 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CBP42338 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CBP42338 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CBP42338 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CBP42338 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CBP42338 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CBP42338 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CBP42338 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CBP42338 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CBP42338 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CBP42338 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIK3CBP42338 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms