Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH1P40925 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH1P40925 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH1P40925 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH1P40925 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH1P40925 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH1P40925 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH1P40925 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH1P40925 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MDH1P40925 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDH1P40925 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDH1P40925 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDH1P40925 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDH1P40925 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MDH1P40925 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDH1P40925 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDH1P40925 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDH1P40925 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDH1P40925 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MDH1P40925 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDH1P40925 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDH1P40925 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDH1P40925 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDH1P40925 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MDH1P40925 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDH1P40925 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDH1P40925 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDH1P40925 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDH1P40925 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDH1P40925 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDH1P40925 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDH1P40925 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MDH1P40925 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDH1P40925 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDH1P40925 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDH1P40925 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDH1P40925 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDH1P40925 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDH1P40925 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDH1P40925 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDH1P40925 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDH1P40925 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MDH1P40925 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDH1P40925 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDH1P40925 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDH1P40925 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDH1P40925 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MDH1P40925 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MDH1P40925 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MDH1P40925 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MDH1P40925 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MDH1P40925 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MDH1P40925 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDH1P40925 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDH1P40925 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDH1P40925 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDH1P40925 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDH1P40925 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDH1P40925 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDH1P40925 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MDH1P40925 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDH1P40925 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDH1P40925 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MDH1P40925 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDH1P40925 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDH1P40925 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDH1P40925 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDH1P40925 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDH1P40925 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDH1P40925 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDH1P40925 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDH1P40925 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MDH1P40925 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDH1P40925 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDH1P40925 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDH1P40925 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDH1P40925 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDH1P40925 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDH1P40925 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MDH1P40925 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDH1P40925 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDH1P40925 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDH1P40925 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDH1P40925 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDH1P40925 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDH1P40925 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MDH1P40925 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDH1P40925 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDH1P40925 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDH1P40925 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MDH1P40925 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDH1P40925 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDH1P40925 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDH1P40925 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDH1P40925 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDH1P40925 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDH1P40925 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDH1P40925 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDH1P40925 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MDH1P40925 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms