Protein–RNA interactions for Protein: P38235

YBR053C, Uncharacterized protein YBR053C, yeast

Predictions only

Length 358 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBR053C	P38235	ARP1	YHR129C	1155 nt		5.03	□□□□□ -1.6
YBR053C	P38235	IST3	YIR005W	447 nt		5.03	□□□□□ -1.6
YBR053C	P38235	PRS1	YKL181W	1284 nt		5.03	□□□□□ -1.6
YBR053C	P38235	RRG9	YNL213C	645 nt		5.03	□□□□□ -1.6
YBR053C	P38235	PDR16	YNL231C	1056 nt		5.03	□□□□□ -1.6
YBR053C	P38235	ETT1	YOR051C	1239 nt		5.03	□□□□□ -1.6
YBR053C	P38235	YPR177C	YPR177C	372 nt		5.03	□□□□□ -1.6
YBR053C	P38235	YJR061W	YJR061W	2808 nt		5.03	□□□□□ -1.6
YBR053C	P38235	ASF2	YDL197C	1578 nt		5.03	□□□□□ -1.6
YBR053C	P38235	TCM62	YBR044C	1719 nt		5.03	□□□□□ -1.6
YBR053C	P38235	IBA57	YJR122W	1494 nt		5.02	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	GAS5	YOL030W	1455 nt		5.02	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	UBA1	YKL210W	3075 nt		5.02	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	MNN2	YBR015C	1794 nt		5.02	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	RAD55	YDR076W	1221 nt		5.02	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	NOP16	YER002W	696 nt		5.02	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	YGL199C	YGL199C	471 nt		5.02	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	YGR111W	YGR111W	1203 nt		5.02	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	CAB4	YGR277C	918 nt		5.02	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	SPG4	YMR107W	348 nt		5.02	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	MDG1	YNL173C	1101 nt		5.02	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	SPS19	YNL202W	879 nt		5.02	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	TPT1	YOL102C	693 nt		5.02	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	CNS1	YBR155W	1158 nt		5.02	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	RRN3	YKL125W	1884 nt		5.02	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	BUD8	YLR353W	1812 nt		5.02	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	BIT2	YBR270C	1638 nt		5.01	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	NSI1	YDR026C	1713 nt		5.01	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	snR83	snR83	306 nt		5.01	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	TIP20	YGL145W	2106 nt		5.01	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	RPS0B	YLR048W	759 nt		5.01	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	BOS1	YLR078C	735 nt		5.01	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	YML119W	YML119W	1074 nt		5.01	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	MRPS17	YMR188C	714 nt		5.01	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	CUS2	YNL286W	858 nt		5.01	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	ZPS1	YOL154W	750 nt		5.01	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	DIM1	YPL266W	957 nt		5.01	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	VTC2	YFL004W	2487 nt		5.01	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	RPT2	YDL007W	1314 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	ART10	YLR392C	1557 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	SER3	YER081W	1410 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	snR56	snR56	88 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	snR7-L	snR7-L	214 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	IRC22	YEL001C	678 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	CWC23	YGL128C	852 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	SOL3	YHR163W	750 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	SNL1	YIL016W	480 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	AAD10	YJR155W	867 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	GSP1	YLR293C	660 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	RIF2	YLR453C	1188 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	YML057C-A	YML057C-A	390 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	YNL050C	YNL050C	813 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	MED7	YOL135C	669 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	YOR114W	YOR114W	885 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	SME1	YOR159C	285 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	snR3	snR3	194 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	MCH4	YOL119C	1506 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	DOA1	YKL213C	2148 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	HXT14	YNL318C	1623 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	THI22	YPR121W	1719 nt		5	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	SET5	YHR207C	1581 nt		4.99	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	YDR261W-A	YDR261W-A	1317 nt		4.99	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	VBA1	YMR088C	1689 nt		4.99	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	IFM1	YOL023W	2031 nt		4.99	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	VAC17	YCL063W	1272 nt		4.99	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	YFH7	YFR007W	1062 nt		4.99	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	RSM27	YGR215W	333 nt		4.99	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	YJL193W	YJL193W	1209 nt		4.99	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	MET31	YPL038W	534 nt		4.99	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	YPL199C	YPL199C	723 nt		4.99	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	LDH1	YBR204C	1128 nt		4.99	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	SLT2	YHR030C	1455 nt		4.99	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	HRR25	YPL204W	1485 nt		4.99	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	NUP116	YMR047C	3342 nt		4.98	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	SPS2	YDR522C	1509 nt		4.98	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	NRD1	YNL251C	1728 nt		4.98	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	SAS10	YDL153C	1833 nt		4.98	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	QRI7	YDL104C	1224 nt		4.98	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	RPN9	YDR427W	1182 nt		4.98	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	YIP5	YGL161C	933 nt		4.98	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	RPL24B	YGR148C	468 nt		4.98	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	RTA1	YGR213C	954 nt		4.98	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	DOG2	YHR043C	741 nt		4.98	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	DOG1	YHR044C	741 nt		4.98	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	YLR339C	YLR339C	552 nt		4.98	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	TRM10	YOL093W	882 nt		4.98	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	IRC13	YOR235W	315 nt		4.98	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	PLP2	YOR281C	861 nt		4.98	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	YBR063C	YBR063C	1215 nt		4.98	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	DUR1,2	YBR208C	5508 nt		4.98	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	COM2	YER130C	1332 nt		4.97	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	CBP1	YJL209W	1965 nt		4.97	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	YFR034W-A	YFR034W-A	288 nt		4.97	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	YGL214W	YGL214W	486 nt		4.97	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	TRX2	YGR209C	315 nt		4.97	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	COS8	YHL048W	1146 nt		4.97	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	AIM18	YHR198C	966 nt		4.97	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	PAU17	YLL025W	375 nt		4.97	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	YLR456W	YLR456W	615 nt		4.97	□□□□□ -1.61
YBR053C	P38235	DUG3	YNL191W	1074 nt		4.97	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.6 ms