Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFBP38117 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFBP38117 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ETFBP38117 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFBP38117 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFBP38117 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFBP38117 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFBP38117 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFBP38117 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFBP38117 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFBP38117 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFBP38117 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFBP38117 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFBP38117 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFBP38117 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFBP38117 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFBP38117 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFBP38117 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ETFBP38117 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFBP38117 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFBP38117 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFBP38117 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFBP38117 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFBP38117 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFBP38117 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFBP38117 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFBP38117 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFBP38117 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFBP38117 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFBP38117 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFBP38117 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFBP38117 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFBP38117 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFBP38117 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFBP38117 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFBP38117 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ETFBP38117 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETFBP38117 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETFBP38117 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETFBP38117 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETFBP38117 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETFBP38117 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETFBP38117 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETFBP38117 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ETFBP38117 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETFBP38117 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETFBP38117 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETFBP38117 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETFBP38117 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ETFBP38117 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFBP38117 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFBP38117 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFBP38117 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFBP38117 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFBP38117 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFBP38117 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFBP38117 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFBP38117 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFBP38117 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFBP38117 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFBP38117 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFBP38117 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFBP38117 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ETFBP38117 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETFBP38117 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETFBP38117 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETFBP38117 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETFBP38117 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETFBP38117 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ETFBP38117 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETFBP38117 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETFBP38117 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETFBP38117 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETFBP38117 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETFBP38117 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ETFBP38117 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ETFBP38117 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ETFBP38117 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ETFBP38117 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms