Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCK1P35558 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCK1P35558 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK1P35558 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK1P35558 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK1P35558 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK1P35558 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK1P35558 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK1P35558 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK1P35558 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK1P35558 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK1P35558 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK1P35558 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK1P35558 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK1P35558 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK1P35558 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCK1P35558 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCK1P35558 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCK1P35558 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCK1P35558 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCK1P35558 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCK1P35558 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCK1P35558 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCK1P35558 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCK1P35558 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCK1P35558 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCK1P35558 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCK1P35558 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCK1P35558 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCK1P35558 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCK1P35558 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCK1P35558 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCK1P35558 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCK1P35558 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCK1P35558 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCK1P35558 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCK1P35558 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCK1P35558 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCK1P35558 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCK1P35558 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCK1P35558 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCK1P35558 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCK1P35558 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCK1P35558 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCK1P35558 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCK1P35558 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCK1P35558 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCK1P35558 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCK1P35558 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCK1P35558 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCK1P35558 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCK1P35558 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCK1P35558 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCK1P35558 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCK1P35558 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCK1P35558 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCK1P35558 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCK1P35558 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCK1P35558 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCK1P35558 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCK1P35558 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCK1P35558 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCK1P35558 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCK1P35558 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCK1P35558 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCK1P35558 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCK1P35558 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCK1P35558 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCK1P35558 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCK1P35558 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCK1P35558 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCK1P35558 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCK1P35558 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCK1P35558 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCK1P35558 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCK1P35558 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCK1P35558 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCK1P35558 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCK1P35558 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCK1P35558 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCK1P35558 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCK1P35558 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCK1P35558 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCK1P35558 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCK1P35558 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCK1P35558 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCK1P35558 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCK1P35558 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCK1P35558 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCK1P35558 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCK1P35558 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCK1P35558 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCK1P35558 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCK1P35558 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCK1P35558 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCK1P35558 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCK1P35558 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCK1P35558 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCK1P35558 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCK1P35558 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms