Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD12P35452 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms